Quando construir a partir do fonte usando o próprio método padrão de ./configure && make && make install, instale CheckInstall primeiro. Você pode pegá-lo em www.asic-linux.com.mx/~izto/checkinstall caso não esteja nos repositórios da sua distribuição. Execute-o ao invés de make install que, no lugar de instalar os novos arquivos diretamente no seu sistema de arquivos, irá primeiro montar um pacote e então instalá-lo. CheckInstall funciona com pacotes Deb, RPM e Slackware. Você pode especificar o tipo no arquivo de configuração ou esperar que ele pergunte quando executado

./configure && make && checkinstall

Além do tipo de pacote, CheckInstall irá perguntar por outros detalhes. A maioria é opcional ou pode ser deixada no valor padrão, mas tenha certeza de que o nome é igual ao da versão anterior que você está substituindo, ou então o seu gerenciador de pacotes ficará confuso. Instalar com CheckInstall também permite a remoção simples do pacote, pois não há necessidade de manter o diretório fonte por perto e alguns programas nem possuem a opção make uninstall.